عالم Gran Pulse يغرق في البحر وما تبقى يسمى الآن Nova Chrysalia. مع بقاء ثلاثة عشر يومًا فقط حتى نهاية العالم، تسود الفوضى في عالم لا يشيخ أبدًا. لا يمكن أن تولد حياة جديدة. الناس بحاجة إلى الخلاص. بصفتك Lightning، فإن مهمتك هي إنقاذ أكبر عدد ممكن من الأرواح حتى يتم نقلهم إلى العالم الجديد. على طول الرحلة، ستواجه وجوهًا مألوفة وتشتبك مع أعداء جدد في جميع الأراضي الجديدة. يجب عليك في النهاية اختيار النفوس التي تريد إنقاذها وأيها ستتخلى عنها وتفهم تمامًا مصير Lightning الحقيقي. كل شيء ينتهي هنا.